Училась на Международном факультете Иркутского государственного университета. Работала в телекомпании «Аист» — программным редактором, продюсером компании. С 2004 г. — режиссёр студии «REC.production». В 2009 г. написала в соавторстве с Е.Гришковцом пьесу «Дом» (премьера состоялась 10 апреля в «Школе современной пьесы», реж. И.Райхельгауз); сделала документальный фильм «Музыкант» о Денисе Мацуеве, премьера которого прошла в Иркутске в сентябре 2009 года. Режиссёрским и сценарным дебютом в художественном кино для Анны Матисон стал фильм «Сатисфакция», выпущенный на экраны в 2010 году. Соавтором сценария выступил Евгений Гришковец, который также снялся в главной роли. Фильм вышел широким прокатом и участвовал в программе фестивалей «Кинотавр», «Меридианы Тихого», «Московская премьера», «Святая Анна», «Voices». Автор сценариев к фильмам «Ёлки-2», «Ёлки-3», «Ёлки 1914», «Млечный путь», «Глазами собаки». В 2014 году по заказу Мариинского театра сняты фильмы-оперы «Левша» (Родион Щедрин), «Семён Котко» (Сергей Прокофьев), «Троянцы» (Гектор Берлиоз). В 2016 году фильм «После тебя» входил в конкурсную программу 29-го Токийского кинофестиваля.